Paul Esterházy arbeitet seit 1996 regelmäßig als Opernregisseur (vor allem Neues Musiktheater), seit 2006 freiberuflich. Er war Chefdramaturg der Oper Bonn (1997–2000), Generalintendant des Theaters Aachen (2000–2005) und hat eine Professur an der Universität für Musik und Darstellende Kunst in Wien inne.