Franz Koppendorfer studierte an der Akademie der bildenden Künste in Wien. Erste eigene Arbeiten führten ihn nach Köln, Basel und Zürich. Er arbeitete u. a. in München (Kammerspiele) und  Berlin an der Volksbühne Ost und am Deutschen Theater (»Bluthochzeit«). Von »Theater Heute« wurde er als Bühnenbildner des Jahres genannt. Eine bedeutende künstlerische Zusammenarbeit verband ihn in den letzten Jahren mit Christoph Nel, Volker Hesse, Ulrich Heising und Nicolas Brieger. Wichtige Produktionen entstanden u. a. auch für das Schauspiel Leipzig (»Menschenfeind«), das Schauspiel Bochum (»Kabale und Liebe«, »Eisenherz«), Schauspiel Köln (»Das Leben ein Traum«), Stadttheater Dortmund (»Die Zauberflöte«) und das Theater Bremen (»Pelléas et Mélisande«).